重庆工商大学档案馆由原渝州大学档案室和原重庆商学院档案室合并组建而成，具有档案管理和服务双重功能。2004年4月由重庆工商大学校长办公室综合档案室升格为副处级建制，2020年5月8日升为正处级建制。原渝州大学档案室和原重庆商学院档案室分别于1995年和1997年达到档案管理国家二级标准。档案馆现有专职工作人员8名，具有硕士学位的工作人员5人，其余为大学本科以上学历。档案馆位于重庆工商大学南岸校区商智楼，馆舍总建筑面积1830平方米，其中库房面积900平方米，用于档案管理和利用服务及办公功能区面积280平方米，校史馆位于博智楼一楼大厅，面积650平方米。
档案馆馆藏最早为1952年，现有重庆工商大学、渝州大学、重庆商学院、重庆第二机器制造工业学校和重庆市第19中学5个档案全宗。5个全宗包括了党群、行政、教学、科研、基建、外事、产品、设备、校产、出版、声像、财会、实物、学生等14个大类共计十二万余卷（袋、件）档案。 档案管理实行部门立卷制，各部门的档案立卷归档工作纳入了学校的年终部门考核指标体系，确保了学校档案工作的正常运行和档案收集的齐备、完整，有效地行使了档案行政管理职能，基本解决了归档难的问题。
重庆工商大学档案馆注重档案信息开发利用，推出档案一站式服务，实现“远程查档”，实现档案查询“零跑腿”，充分发挥档案馆藏为学校发展服务的作用，年平均利用率2500人次、近万件次。同时，面向社会开展了对学历、学位的认证服务，取得了较好的社会效益，充分发挥了档案资源的现实作用。
为了充分发挥档案的教育功能，学校于2006年底建成校史馆，成为学校爱国主义教育基地，在2012年学校60周年校庆时重新装修，在校庆活动中获得各级来宾及全校师生的好评，2017年进行了焕新升级，年接待参观者达8500人次。2017年建成全景VR网上校史馆,可通过线上方式访问校史馆，突破了时间和空间的限制，给人以身临其境的全景现场体验。2022年校庆70周年建成VR沉浸式穿越校史虚拟场景。
重庆工商大学档案馆加快了现代化建设步伐。把档案管理的现代化建设纳入学校“数字化校园”建设总体规划之中，现已对档案的检索进行计算机管理，完成馆藏档案数字化建设，通过网络全文查询检索提高了查准率、提高了服务质量。馆库中配备有高压细水雾消防系统、视频监控系统、除湿机等安全保管设施，有力提升了安全管理水平。
